Presidencia: Manuel María Fernández Ilarraza (1987- julio 1988); Félix Palomo Saavedra (1988-1991)
Tras las elecciones autonómicas del 10 de junio de 1987 se constituía la Asamblea de la II Legislatura (1987-1991). Inicialmente se forman los grupos Socialista, Alianza Popular, Centrista y Mixto.
En junio de 1988, el Grupo Centrista se disolvió por la pérdida de dos de sus diputados que se incorporaron al Grupo Mixto. La modificación de Reglamento de la cámara en julio de 1988, permitió formar grupo parlamentario con solo dos diputados, constituyéndose el Grupo Riojano Progresista y de nuevo el Grupo Centrista.
En enero de 1989, Alianza Popular y PDP se refundan en el Partido Popular y el grupo parlamentario pasa a llamarse Grupo Parlamentario Popular.
Tras la moción de censura que llevó a la presidencia a José Ignacio Pérez Sáenz, la composición del Parlamento, en enero de 1990, era la siguiente:
Grupo Socialista, 14 diputados;
Grupo Popular, 13 diputados;
Grupo Riojano Progresista, 3 diputados;
Grupo Centrista, 2 diputados;
y Grupo Mixto, 1 diputado.
Posteriormente, en noviembre de ese mismo año, el Grupo Riojano Progresista pasa a denominarse Grupo Riojano.